パズドラの回答詳細

コンボ強化⇒7コンボで火力アップ
無効貫通、ウェイ、L字⇒指定の消し方をした"部分のみ"火力アップ

この差です。
例えば無効貫通とコンボ強化を持つキャラで正方形&7コンボを組めば、コンボ強化の2倍は無効貫通の倍率に乗せて計算できるので火力は2.5×2と単純に乗算で計算出来ます。
それに対し、無効貫通とL字を持つキャラで正方形とL字を組んだときは正方形部分は2.5倍され、L字消し部分は1.5倍されそのあと和算のイメージでダメージが決まります。無効貫通は正方形消しした部分のみでなくそのキャラの攻撃が全て貫通するのでL字消しした部分のダメージもきちんと通りますが、無効貫通の2.5倍と乗算で計算することが出来ないためどうしても火力は低くなります。

わかりやすく、正方形消し(9個消し)の攻撃力を1000、L字消し(5個消し)の攻撃力を500として、正方形とL字を含む7コンボをするとします。実際は違う数値ですしもっと複雑な計算になりますが、倍率の掛かり方のイメージだけ↓

①無効貫通×1とコンボ強化×1所持のキャラの場合
(1000×2.5+500)×2＝6000
↑まるっと2倍

②無効貫通×1とL字×2所持のキャラの場合
1000×2.5+500×1.5×1.5＝3625
↑個々に倍率が掛かる

「L字2個持ちなら1.5×1.5＝2.25倍だからコンボ強化1個持ちの2倍よりも無効貫通火力出せるじゃん！」とはなりません。残念ながら。
まぁ要は、無効貫通はコンボ強化と組み合わせるのが最強でウェイやLと組み合わせてもいまいちってことです。
ちなみに超追撃の2倍もちゃんと無効貫通に乗りますので、超追撃とも相性抜群ですb