MP龍購入について

どちらも運用自体は出来ますね。
ヨミドラ側はオオクニ、明智、エスカマリ等がいないので選択肢は狭いですけど。

MP龍はBOXはあくまで運用出来るかどうかの判断しかできません。
一定基準を満たしているなら後は自分がどういうPTを必要としているのか、この部分で考えて購入を検討してください。
因みに、一定ラインまでの難易度を高速で回したい、ランキングダンジョン上位を狙いたいといった周回機を必要とするならシヴァドラを、闘技場1や多くのギミックに対応できる安定したPTが欲しいならヨミドラを購入すると良いでしょう。

シヴァドラには真田がいないのでウルドとの組み合わせができませんし
アレスも１体しかいなのならあきらめたほうがいいと思いますし
ヨミドラには必須といえるオオクニとエスカマリがいないのなら
普通に使いずらいので両方とも買わずに
サブがちゃんとそろってからまた考えたほうがいいと思います

どちらも運用は可能だと思いますので、周回用PTが欲しいならシヴァドラ、ある程度高難易度ダンジョンを攻略するPTが欲しいならヨミドラという感じで、用途に合わせて選べば良いかと思います。

どちらかと言えば、シヴァドラの方が若干運用しやすいかなという印象は受けますね。
ヨミドラはある程度の高難易度ダンジョンには対応可能だと思いますが、闘技場レベルを攻略するにはサブが足りない印象です。
ヨミドラはサブとしても優秀ですので、闇PTをメインに使っていくならそのあたりも加味して購入するのもありだと思いますよ。

ただ新しいMP龍も発表されたので、あまり課金されないのであれば、そちらが出揃ってから決めても良いのかなと思います。