一体しかいない

1行で書くなら
１、用途が違うからどっちもあり
２、視野を広げてみるならセイバーの圧勝


こうなります。超覚醒を含めた無効貫通３は相当使えます
月クエストを消化する際にも役に立ちます。3色ですごい火力が出るので

一方オルタは火力専門。無効貫通はなかなか難しいでしょう＝汎用性が低い。軽減ありとはいえＨＰ倍率2.25倍なので安定感にも欠けます。

基本的に今のキャラはどれも強いのでどう遊びたいかで決めてみてはどうでしょうか

汎用性か特化型か。この一点です。
セイバーは3色から高倍率で、自身のスキルも溜まりやすいので様々な場面で使いやすく安定感があり、無効貫通枠として様々なパーティーのサブでも起用できます。リーダー時には50%以上で無条件に35%軽減が発動し、リーダーフレンド合わせれば半減を超えるので先制ダメージにも非常に強いです。
セイバーオルタは、その圧倒的な火力（単体1億越え）を活かして異形などをエンハなしでクリアしていける化け物。半面、スキルは自分がリーダーでなければ使いづらく、サブ候補もロシェや天ルシなどに限られてくる。先制にはそこまで強くないので、闘技場のようにある程度敵のパターンがわかっていて必要な対策ができるときしか使えない。また、リーダー運用する場合、できれば自身にバイザーを付けて火力を大幅に上げたい。そのためには2体目が必要…。
結論、1体しか持っていないならセイバーのままで置いておくことをオススメします。せっかくの強いキャラなので、使わずに倉庫番ももったいないですし、有効活用できるほうで。