モンポドラゴンを買うならどちらがいいでしょうか？

私ならヨミドラを購入します。

理由としては、次のとおりです。
①シヴァドラはある程度の難易度のまでの周回特化リーダー、
　ヨミドラは最高難易度は難しいですが高難易度を攻略でき、
　かつ周回でも使用できるリーダーという認識です。
　高難易度攻略でも周回でも使用できるヨミドラの方が
　色々と使用できて便利かなと思います。
②ヨミドラの場合、リーダーとして使用するのに加え、
　覚醒ダルシパ等のサブとしても使用できます。
　逆にシヴァドラをサブで使用することは
　現状ないと思われます。
③サブを見ると、エスカマリをお持ちの分
　ヨミドラの方がやや充実していると感じます。

LF　ヨミドラ　S エスカマリ　カストル　闇ゼウス　カストルorダルシ
LF　ダルシ　S エスカマリ　カストル　ヨミドラ　ズオー

といったパーティを育成すれば、
例えば闘技場1のクリアも十分視野に入ってきますので、
ヨミドラの方が良いのでは思います！

一つ厳しく言わせてもらうと、今のままではゆうて買う意味はありません。
まだまだサブが揃っておらず買ったとしても、あまり使いこなせないかと思います。
が、個人的にはヨミドラの方が将来的にはいいと思います。エスカマリを持っているのならあとはカストル育成と明智、オオクニハクなどを引くだけです、この辺のモンスターは闇フェスで簡単に手に入れる事ができるのですぐ強くなれます。エスカマリをもちながらもそれを捨ててまでシヴァドラにする価値はあまりないです。

正直、どっちを買っても大丈夫です

これからしばらくガチャ封印して育成をガチるとかでもなければ、シヴァドラに使えるモンスターもヨミドラに使えるモンスターも引いてくるでしょう。むしろ買った方のパーティで使えるモンスターが出やすい時にガチャを引くと言う手も有ります。スキラゲ、プラマラ、潜在、継承と、最高難易度に挑むにあたり、やる事は山積みです。シヴァドラ、ヨミドラの速さの違い等微々たる物なので、案ずるより生むが易し、だと思いますよ