互換なスキル

パッと思い付いたのが、ラスト・ロマノフと進化前V
ですね。列生成場所が若干違いますが、どちらも１列生成＋１ターンヘイストです。
ロマノフが８ターンで最下段生成、Vは７ターンで最下段から２つ目に列生成です。

パズル組む事考えるとロマノフが楽ですが、周回やら考えるとVの方が利便性が高いです。
実際、友人の周回パは敷居高過ぎる上に高難易度もクリア可能なハイスペックパです。
編制はリーダー進化前V、変身遊戯でサブが、進化前V×3、進化遊戯です。
諭吉3.5人が生け贄に捧げられた渾身のパーティーらしいです。

スルトとゴエモンの火花火スキルは名前だけ違うので完全相互互換に該当すると思います。
また、ダメージスキル除くの定義に少し違反しますが究極ナコルルはアシスト可能で火花火に加えて単体250倍闇ブレスが加わるためダメージ吸収を考慮しないならば完全上位互換です。

割合ダメージがダメージスキルの定義から外れるなら、サクヤの四神乱舞はスキルターンとアシスト可能な点でマステリオンのダーク・ブラスターの完全上位交換です。

完全相互互換(コンボ加算とロック)
リーリアと間桐慎二
コンボ加算(1t1c)消してスキルターン5減らしたのがメノア
完全上位互換(防0)
金剛力士のカードとトップ・ドロイドラゴン
アシスト可な10tとアシスト不可な12t